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http://dspace.utpl.edu.ec/handle/123456789/13535| Title: | Identificación molecular de morfotipos Hemileia vastatrix causante de la roya del café en la provincia de Loja |
| Authors: | Rojas Rojas, Jacqueline Elizabeth Calderón Rueda, Ximena Soledad |
| Keywords: | Café - Enfermedades y plagas Hemileia vastatrix - Morfología Café - Hongo de la roya Roya del cafeto Hongo vastatrix Biólogo – Tesis y disertaciones académicas |
| Issue Date: | 2016 |
| Citation: | Calderón Rueda, Ximena Soledad.(2015). Identificación molecular de morfotipos Hemileia vastatrix causante de la roya del café en la provincia de Loja. (Trabajo de Titulación de Biólogo). UTPL, Loja. |
| Abstract: | Hemileia vastatrix, commonly known as coffee rust, has caused great losses for the coffee producers. In the present research, the genetic diversity in the different coffee rust morphotypes was studied on infected plants, which were collected in Loja Province, through the analysis of the Ribosomal DNA; these were compared to sequences obtained from GenBank. The analysis of the ITS1, 5.8S, and ITS2 regions in H. vastatrix grouping allowed us to obtain two genotypes that presented a 10% correlation, as well as a complete differentiation of the sequences originated from Colombian strains; however, while analyzing the partial 28S region it was determined that these two genotypes aren’t different, in spite of the morphological differences they present, that can obey climatic or anthropogenic factors (cultivation age, use of fungicides) ; as well as the pathogen’s own characteristics like the reproductive cycle, which was determined as entirely asexual, limiting its genetic variability. |
| Description: | Hemileia vastatrix comúnmente denominada roya del café ha ocasionado grandes pérdidas para los productores, en el presente trabajo se estudió la diversidad genética en los diferentes morfotipos de la roya del café en plantas infectadas, los cuales fueron colectados en la provincia de Loja, por medio del análisis de secuencias de ADN ribosomal, las cuales se compararon con secuencias obtenidas del GenBank. El análisis de agrupamiento de las regiones ITS1, 5.8S, ITS2 de H. vastatrix permitió obtener dos genotipos los cuales presentaron una correlación del 10%, además de una completa diferenciación de las secuencias procedentes de cepas colombianas (GenBank), sin embargo al analizar la región 28S parcial se determinó que estos dos genotipos no son diferentes, pese a las diferencias morfológicas que presentan, las cuales pueden obedecer a factores climáticos, antropogénicos ( edad del cultivo, uso de fungicidas), así como a características propias del patógeno como lo es su ciclo reproductivo, el cual se ha determinado es únicamente asexual, lo cual limitaría su variabilidad genética. |
| URI: | http://dspace.utpl.edu.ec/handle/123456789/13535 |
| Appears in Collections: | Biólogo |
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