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http://dspace.utpl.edu.ec/handle/123456789/15915| Title: | Hacia una nueva filogenia de Tulasnella mediante la combinación de descriptores moleculares |
| Authors: | Sánchez Rodríguez, Aminael Armijos Carrión, Angelo Damián |
| Keywords: | Filogenia Talasnella-Microbiología Biologo-Tesis y disertaciones académicas |
| Issue Date: | 2016 |
| Citation: | Armijos Carrión Angelo Damián.(2016).Hacia una nueva filogenia de Tulasnella mediante la combinación de descriptores moleculares (Trabajo de titulación de Biólogo).UTPL.Loja |
| Abstract: | The high genetic variability that occurs in mycorrhizal fungi of the genus Tulasnella in the ITS region of the gene nrDNA difficult to generate statistically reliable phylogenies by methods that depend on the alignment of ITS sequences. As a result of this variability phylogenies it is often ambiguous, that do not allow adequate correlation of molecular data (ITS sequence), and morphological obtained for pure or isolated basidiomata of Tulasnella spp. From this, in the present study new methodologies are proposed to increase the reliability of phylogenies obtained for Tulasnella using distance matrices. To this end ITS sequences belonging to 383 species of Tulasnella were used. Phylogenies were obtained from three strategies: 1) single multiple alignment, not only dependent descriptors structural alignment and 3) a combination of 1) and 2) using the statistical procedure known as DISTATIS. Our results allowed us to conclude that the best phylogenies are obtained from alignment and DISTATIS. The new phylogenies obtained open the possibility of reconciling molecular information with morphological isolates Tulasnella |
| Description: | La alta variabilidad genética que se presenta en los hongos micorrízicos del género Tulasnella en la región ITS del gen nrDNA dificulta la generación de filogenias estadísticamente confiables por medio de métodos que dependen del alineamiento de secuencias ITS. Como resultado de esta variabilidad se muestran filogenias muchas veces ambiguas, que no permiten la correlación adecuada de los datos moleculares (secuencia ITS), y morfológicos obtenidos para aislados puros o de basidiomas de Tulasnella spp. A partir de esto, en el presente estudio se proponen nuevas metodologías para aumentar la confiabilidad de las filogenias obtenidas para Tulasnella mediante la utilización de matrices de distancia. Con este fin se emplearon 383 secuencias ITS pertenecientes a especies del género Tulasnella. Las filogenias se obtuvieron a partir de tres estrategias: 1) solo alineamiento múltiple, solo descriptores estructurales no dependientes de alineamiento y 3) la combinación de 1) y 2) mediante el procedimiento estadístico conocido como DISTATIS. Nuestros resultados nos permitieron concluir que las mejores filogenias se obtienen a partir de alineamiento y DISTATIS. Las nuevas filogenias obtenidas abren la posibilidad de reconciliar informaciones moleculares con morfológicas de aislados de Tulasnella |
| URI: | http://dspace.utpl.edu.ec/handle/123456789/15915 |
| Appears in Collections: | Biólogo |
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