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http://dspace.utpl.edu.ec/handle/123456789/17081| Title: | Caracterización morfo-molecular de Xylaria spp. en la Reserva Biológica San Francisco como aporte taxonómico y diversidad de la micobiota del Sur del Ecuador |
| Authors: | Cruz Sarmiento, Darío Javier Chamba Quezada, Crystopher Andrés |
| Keywords: | Hongos – Estudio Xylaria – Caracterización, Morfología-molecular Biólogo – Tesis y disertaciones académicas |
| Issue Date: | 2017 |
| Citation: | Chamba Quezada, Crystopher Andrés. (2017). Caracterización morfo-molecular de Xylaria spp. en la Reserva Biológica San Francisco como aporte taxonómico y diversidad de la micobiota del Sur del Ecuador. (Trabajo de Titulación de Biológo). UTPL, Loja |
| Abstract: | The genus Xylaria contains several species mainly located in tropical regions like Ecuador, however the amount of taxonomic and phylogenetic studies reported are scarce. Therefore, the objective of the present study was to perform a morpho-molecular characterization of 20 Xylaria specimens collected in the San Francisco Biological Reserve (RBSF), Zamora-Chinchipe. Morphologically it was possible to classify 11 specimens in eight morpho-species, one specimen was not able to relate to any known epithet, so it can be treated of a new species. The remaining eight specimens by their asexual status were not able to classify for any morpho-species. Molecularly only 19 sequences were obtained to the ITS-5.8S and partial LSU regions, which were grouped into 13 clades. Eight of the 13 clades were correlated with morphological definitions at the species level and an asexual specimen was included within the clade with a sequence named Xylaria aff. comosa. The remaining five genotypes had no relationship to the available sequences. According to the OTUs definition, the 3% threshold for the ITS region is imprecise to define species in these group of Xylaria spp |
| Description: | El género Xylaria contiene varias especies localizadas principalmente en regiones tropicales como Ecuador, sin embargo la cantidad de estudios taxonómicos y filogenéticos reportados son escasos. Por lo que el objetivo del presente estudio fue realizar una caracterización morfo-molecular de 20 especímenes de Xylaria colectados en la Reserva Biológica San Francisco (RBSF), Zamora-Chinchipe. Morfológicamente se logró clasificar 11 especímenes en ocho morfo-especies, un espécimen no se logró relacionar a ningún epíteto conocido, por lo que se puede tratar de una nueva especie. Los ocho especímenes restantes por su estado asexual no se lograron clasificar para ninguna morfo-especie. Molecularmente se obtuvieron solamente 19 secuencias de la region ITS-5.8S y LSU, que se agruparon en 13 clados. Ocho de los 13 clados se correlacionaron con las definiciones morfológicas a nivel de especie, un espécimen en estado asexual se incluyó dentro del clado con una secuencia denominada Xylaria aff. comosa. Los cinco genotipos restantes no presentaron ninguna relación con las secuencias disponibles. Acorde a la definición de OTUs empleado, el umbral de 3% para la región ITS resulta impreciso para definir especies en Xylaria |
| URI: | http://dspace.utpl.edu.ec/handle/123456789/17081 |
| Appears in Collections: | Biólogo |
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