Taxonomic classification of endophytic fungi associated with epiphytic orchid roots based on a new generation sequencing technology

Abstract

Abstract: El bosque nublado de montaña en el sur de Ecuador alberga una gran diversidad de especies de orquídeas epífitas que forman interacciones con hongos endófitos asociados a raíces (RAF). Actualmente, avances en las tecnologías de secuenciación permiten la identificación de una diversidad de hongos más amplia, pero la falta de precisión en la identificación taxonómica representa un desafío para alcanzar una mejor comprensión del rol de las comunidades de endófitos en las orquídeas. En este estudio, evaluamos las comunidades de RAF de cinco especies de orquídeas epífitas en dos áreas de bosque nublado. Con un enfoque metagenómico de ITS2, se asignó una identidad taxonómica a 3413 OTUs. Además, se realizó un análisis filogenético de los hongos no micorrízicos más abundantes del orden Agaricales y se contrastó con un PERMANOVA las comunidades de RAF entre dos áreas geográficas, las mismas que mostraron diferencias significativas. Finalmente, se comprobó mediante modelos lineales generalizados la influencia del sitio de colección y la especie de orquídea hospedera sobre las comunidades de RAF. Nuestros hallazgos contribuyen a una mejor comprensión de las interacciones orquídeas-RAF en ecosistemas.